工商管理學院是沈陽藥科大學成立最早的二級學院，是國內醫(yī)藥院校中最早開展管理專業(yè)人才培養(yǎng)的院系，是國內第一個從事藥事管理博士研究生教育的學院。學院始建于1981年，1987年開始招收全日制本科生，1995年組建工商管理學院, 1994年開始招收碩士研究生，2000年開始招收博士研究生。目前學院已經形成了本科、碩士和博士層次完整的教育體系。
學院下設藥事管理、工商管理、市場營銷、藥物經濟學四個教研室，現(xiàn)有教工40人，其中專任教師32人。教師中有教授6人，兼職教授31人，副教授12人，具有博士學位的教師占教師總數(shù)的73%。教師在藥物信息協(xié)會(DIA)、香港交易所生物科技咨詢小組、中國藥學會、中國藥品監(jiān)督管理研究會、中國藥師協(xié)會、中國醫(yī)藥企業(yè)管理協(xié)會、國家發(fā)改委藥品價格評審專家委員會、國家商務部產業(yè)發(fā)展專家委員會等組織以及《國際公共衛(wèi)生雜志》、《中國藥學雜志》、《中國藥房》等十幾家雜志有社會兼職。
學院現(xiàn)有藥學一級學科（包括藥事管理學1個二級學科）博士、碩士學位授予點1個；工商管理一級學科碩士學位授予點1個；碩士專業(yè)學位授予點1個，即藥學碩士（藥事管理學研究方向）；藥事管理、工商管理、市場營銷、本科專業(yè)3個。學院目前在校本科生924人，碩士生126人，博士生38人?，F(xiàn)已培養(yǎng)藥事管理博士畢業(yè)生80余名，占國內同專業(yè)畢業(yè)生總數(shù)的85%，碩士畢業(yè)生500余名。
近年來，學院完成了世界衛(wèi)生組織、國家藥品監(jiān)督管理局、衛(wèi)生部、科技部、教育部等研究課題300余項；發(fā)表學術論文2000余篇；公開出版專著和教材230余部；獲得科研獎勵70余項；建立了沈陽藥科大學監(jiān)管科學與產業(yè)發(fā)展研究中心和沈陽藥科大學醫(yī)藥數(shù)據(jù)研究中心；創(chuàng)辦了《亞洲社會藥學》雜志。
學院堅持對外交流。與美國Alliant大學建立了本科生互換人才培養(yǎng)合作關系，與中國藥科大學、復旦大學、北京大學、歐洲監(jiān)管科學協(xié)會、澳門大學、美國南加州大學共同成立了國際藥事監(jiān)管教育推行委員會，簽署了戰(zhàn)略合作協(xié)議；與美國Amgen公司、德國拜耳公司等國內外知名企業(yè)建立了教育與科技合作關系。
學院將緊緊圍繞學校辦學宗旨，進一步加強內涵建設，以學科建設為主線，以教學改革為核心，以全面育人為根本，立足藥學，突出特色，注重品質，創(chuàng)新發(fā)展，奮力開啟藥學領域國際知名、國內一流的工商管理學院建設的新征程。

沈陽藥科大學工商管理學院1987年組建企業(yè)管理系，1996年成立工商管理學院，是學校最早的二級分院，2001年正式設立國內醫(yī)藥院校中第一個企業(yè)管理碩士點，同年招收企業(yè)管理碩士研究生。近年來，許多醫(yī)藥企業(yè)單位在學院攻讀營銷方向的工商管理碩士學位。此外，學院在北京、哈爾濱、大連、安徽等地開辦了九個藥事管理研究生課程進修班。目前已畢業(yè)的本科學生在全國各地，發(fā)揮著骨干作用，深受用人單位的歡迎，他們當中的許多人已成為國內外藥學界的專家和骨干。
本專業(yè)核心教師在社會中兼任重要職位，教師分別擔任中國管理科學研究院學術委員會特約研究員、中國藥學會藥品知識產權專業(yè)委員會委員、遼寧省藥學會醫(yī)藥經濟委員會副主任委員、中國管理科學研究院企業(yè)管理創(chuàng)新研究所高級研究員、中國藥學會高級會員、中國醫(yī)藥企業(yè)管理協(xié)會理事、中國醫(yī)藥企業(yè)家協(xié)會理事、中國藥學會中國藥事專業(yè)委員會委員等重要職位。本專業(yè)教師還積極與校外醫(yī)藥企事業(yè)單位交流與合作，在國內醫(yī)藥界有較大的影響力。與美國Alinat大學建立了本科學生（2+2）互換培養(yǎng)計劃協(xié)議。
培養(yǎng)目標
本專業(yè)為遼寧省示范專業(yè)。培養(yǎng)學生具有系統(tǒng)掌握工商管理的基本理論、基本知識和基本技能，具備一定的藥學基本理論知識，具有國際化視野、創(chuàng)新意識、團隊精神，具備良好的人文精神、科學素養(yǎng)和自主獲取知識和應用知識的能力的高級醫(yī)藥管理應用型、復合型專業(yè)人才。
就業(yè)方向
畢業(yè)生能夠在各類藥品生產和流通企業(yè)、藥品監(jiān)管機構及相關事業(yè)單位、高等院校、醫(yī)藥行業(yè)咨詢機構等領域從事管理及研究工作。
培養(yǎng)要求
畢業(yè)生應獲得以下幾方面的知識和能力：1）掌握管理學、經濟學等工商管理（醫(yī)藥）專業(yè)必備的相關基礎學科基本原理、基本知識和基本技能；2）熟悉化學、藥物化學、藥理學、藥劑學和藥物分析等藥學主要分支學科的基本理論知識；3）掌握財務管理、戰(zhàn)略管理、生產運作管理、質量管理和管理信息系統(tǒng)的基本理論、基本知識和基本技能；4）掌握藥事管理法規(guī)政策，熟悉我國企業(yè)管理的有關方針、政策和法規(guī)；5）受到社會科學研究方法的基本訓練，具有醫(yī)藥生產與流通企業(yè)診斷、分析、策劃與咨詢的初步能力；6）具有運用信息技術、文獻檢索方法和相關定性、定量方法分析處理本專業(yè)有關問題的能力；7）能夠比較熟練地閱讀和翻譯本專業(yè)英文文獻和有關資料，具有一定科學研究和應用的實際工作能力，具有批判性思維能力；8）具有較強的自學能力并為接受專業(yè)繼續(xù)教育奠定必要的專業(yè)基礎；9）了解本專業(yè)領域科學理論前沿和發(fā)展動態(tài)及相關學科新知識。
主要課程
宏觀經濟學、微觀經濟學、管理學、會計學、經濟法、藥事管理學、組織行為學、人力資源管理、戰(zhàn)略管理、財務管理、生產運作管理、質量管理、管理信息系統(tǒng)、市場營銷學、藥物經濟學、運籌學、藥物化學、藥理學、藥物分析、藥劑學。